马昕
最后学位：东南大学工学博士
岗位职称：副教授
研究领域：生物信息学
教学课程：微积分、线性代数、概率论与数理统计
办公室：竞慧西楼410
电 话：86-025-58318699
Emai l ：maxin@nau.edu.cn
通讯地址：南京市浦口区雨山西路86号
邮 编：211815
学习简历
1999.09 – 2003.06 苏州大学数学科学学院 数学与应用数学专业 理学学士
2003.09 – 2006.06 苏州大学数学科学学院 应用数学专业 理学硕士
2008.09 – 2012.09 东南大学生物医学工程学院 生物医学工程专业 工学博士
工作简历
2006.06 - 2008.10南京审计大学助教
2008.10-2014.07南京审计大学 讲师
2014.07 –现在南京审计大学 副教授
主持参与课题
1. DNA\RNA相互结合的蛋白质预测与统计分析，国家自然科学基金，项目批准号：61305072（主持人）
2. 基于机器学习算法的SmallRNA-结合位点预测，江苏省高校自然科学研究计划项目，项目批准号：14KJB520020（主持人）
3. 基于序列的蛋白质与DNA相互作用的预测研究，江苏省高校自然科学研究计划项目，项目批准号：12KJD520006（主持人）
4. 支持向量机和随机森林算法在海量数据分析中的应用，南京审计大学校级课题，项目批准号：NSK2009/01（主持人）
5. 人类基因组遗传变异与核小体定位的相互作用研究，国家自然科学基金，项目批准号：31240080（参与，4/8）
6. 核小体定位的动态调控信息分析，国家自然科学基金，项目批准号：61073141（参与，6/10）
7. 动态核小体定位及其在癌细胞中的基因调节作用研究，江苏省自然科学基金面上项目，项目批准号：BK2010406（参与，9/9）
科研成果
1、Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun, DNABP: Identification of DNA-binding proteins based on feature selection using a random forest and predicting binding residues, PLoS ONE, 11(12):e0167345, 2016. (SCI)
2、Xin Ma*, Jing Guo, Ke Xiao and Xiao Sun，PRBP: Prediction of RNA-binding proteins using a random forest algorithm combined with an RNA-binding residue predictor, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,12（6），1385-1393,2015. (SCI)
3、Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun Sequence-Based Prediction of RNA-Binding Proteins Using Random Forest with Minimum Redundancy Maximum Relevance Feature Selection，BioMed Research International， volume 2015, Article ID 425810, 10 page http://dx.doi.org/10.1155/2015/425810, 2015. (SCI）
4、Xin Ma* and Xiao Sun，Sequence-based predictor of ATP-binding residues using random forest and mRMR-IFS feature selection, Journal of Theoretical Biology, 360: 59-66, 2014. (SCI）
5、Xin Ma*, Jian-Sheng Wu and Xiao-Yun Xue, Identification of DNA-binding proteins using support vector machine with sequence information, Computational and Mathematical Methods in Medicine,2013:524502, doi: 10.1155/2013/524502, 2013. (SCI）
6、Xin Ma, Jing Guo, Hong-De Liu, Jian-Ming Xie and Xiao Sun*，Sequence-based prediction of DNA-binding residues in proteins with conservation and correlation information, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 41(2), 213-224, 2012. (SCI)
7、Xin Ma, Jing Guo, Jian-Sheng Wu, Hong-De Liu, Jia-Feng Yu, Jian-Ming Xie and Xiao Sun*, Prediction of RNA-binding residues in proteins from primary sequence using an enriched random forest model with a novel hybrid feature，Proteins, 79(4), 1230-1239, 2011.（SCI）
8、马昕，郭静，孙啸*，蛋白质中RNA-结合残基预测的随机森林模型，东南大学学报（自然科学版），42(1)，50-54，2012. (EI)
9、Hong-De Liu*, Kun Luo, Hao Wen, Xin Ma, Jian-Ming Xie, Xiao Sun， Quantitative analysis reveals increased histone modifications and a broad nucleosome-free region bound by histone acetylases in highly expressed genes in human CD4(+) T cell, Genomics, 101(2), 113-119. 2013. (SCI）
10、 Chang-Chang Cao, Cheng Li, Zheng Huang, Xin Ma and Xiao Sun*, Identifying rare variants with optimal depth of coverage and cost-effective overlapping pool sequencing, Genetic epidemiology, 37(8), 820-30, 2013. (SCI)
11、 刘宏德* , 罗坤 , 马昕，核小体及染色质修饰的基因组分布模式和染色质状态, 生物化学与生物物理进展，40(11): 1088-1099，2013. (SCI)
12、 刘宏德*，张德金，谢建明，袁志栋，马昕，卢志远，龚乐君，孙啸，miRNA基因和编码基因启动子区核小体定位分析，科学通报，2010,55（14），1335-1340. （SCI）
13、 Yang, Yang*, Xin Ma and Jin-Guan Lin., Approximation for the finite-time ruin probability of a general risk model with constant interest rate and extended negatively dependent heavy-tailed claims. Mathematical Problems in Engineering, Article ID 852852, 14 pages, doi:10.1155/2011/852852. (SCI)
14、 Yang, Yang., Jin-Guan Lin, Chao Huang and Xin Ma，The finite-time ruin probability in two non-standard renewal risk models with constant interest rate and dependent subexponential claims. Journal of the Korean Statistical Society, 41, 213-224，2012. (SCI)
15、 Pei-Lin Zhang , Xin Ma , Zhi-Long Peng and Wen-Xin Qin，Monotonicity in the damped pendulum type equations，Zeitschrift fur angewandte Mathematik und Physik （ZAMP）, 60（5），823-839，2009. (SCI)
16、 Wen-Xin Qin , Chun-Lan Xu and Xin Ma，Stability of Single-Wave-Form Solutions in the Underdamped Frenkel- Kontorova Model，SIAM Journal on Mathematical Analysis，40（3），952-967，2008. （SCI）
17、 蛋白质-核酸复合物氢键与范德华力作用位点分析，东南大学学报(自然科学版), 41(4), 771-783，2011 (EI)
科研奖励
1. 马昕，2014，江苏省青蓝工程优秀青年骨干教师，江苏省教育厅